eCTD（Electronic Common Technical Document）电子提交通过以下方式减少大量数据处理的时间：

1. 数据分类与标识：在eCTD提交前，企业应对数据进行分类，明确哪些数据属于敏感数据。可以使用元数据标签或水印等方式标识敏感信息，以便在后续处理中采取相应措施。

2. 数据匿名化与假名化：对于患者数据，匿名化和假名化是常用的处理方式。匿名化是指彻底删除或替换所有可识别信息，使数据无法关联到特定个体。假名化则是用假名替换真实信息，保留数据的分析价值。这两种方法都能有效降低数据泄露的风险。

3. 加密与访问控制：在eCTD提交过程中，加密是保护敏感数据的关键技术。企业应采用强加密算法对数据进行加密，确保即使数据被截获，也无法被解读。访问控制机制也至关重要，只有授权人员才能访问敏感数据。

4. 数据生命周期管理：从数据收集到销毁，企业应建立完整的数据生命周期管理流程。例如，在eCTD提交完成后，应及时删除或归档不再需要的敏感数据，减少数据泄露的风险。

5. 使用专业软件：eCTD申报材料的准备涉及XML Backbone的创建、DTD和Stylesheet文件的管理、文件生命周期（Lifecycle）的管理以及模块5加密，目前国际知名制药公司（如Pfizer, Merck, AZ）都是购买专业的软件来进行eCTD申报，目前主流的软件有CSC公司的eCTDXPress和PAREXEL公司的LIQUENT。

6. 遵循eCTD格式要求：按照eCTD格式要求整理申报资料，确保文件结构清晰、便于查阅。例如，eCTD格式主要包括序列号（Sequence）、区域代码（Area Code）、文档类型代码（Document Type Code）、文档编号（Document Number）、版本号（Version）等，按照这些要求整理资料可以提高处理效率。

7. 电子签名：对转换后的XML文件进行电子签名，确保文件的真实性和完整性，这在一定程度上可以减少数据处理过程中的验证等时间。

8. 文件压缩与加密：为提高传输速度和保障数据安全，建议对eCTD文件进行压缩和加密，这有助于减少数据传输和处理的时间。